As linhas de pesquisa presentes no Grupo de Pesquisa em Estatísticas Públicas (EstatPúblicas) da Fundação João Pinheiro são:

• Métodos e qualidade de dados: linha de pesquisa destinada aos estudos de metodologia de cálculo, discussões sobre fontes de dados, procedimentos de revisão, crítica e validação e imputação de dados. 
• Indicadores e Índices compostos: linha de pesquisa destinada aos cálculos de indicadores nas temáticas demográficas, econômicas, sociais, ambientais e transversais e aos estudos da análise desses indicadores. Além disso, incorpora as pesquisas que envolvem os estudos de índices como o Índice de Desenvolvimento Humano Municipal e suas variações e o Índice Mineiro de Responsabilidade Social.
• Transformação digital: linha de pesquisa destinada aos estudos e aplicações da transformação digital em diferentes etapas da produção da estatística desde a extração de dados, rotinas de processamento até a produção de produtos de disseminação como plataformas de dados.